服务器证书通过业务受理点申请，密钥对由RA中心产生，密钥位长为1024位，服务器证书用于电子商务应用系统中的服务器软件向其余企业和个人提供电子商务应用时使用，证书和密钥由服务器软件自身管理。服务器软件作为电子商务服务提供者，利用证书机制保证与其他服务器或个人通信的安全。

服务器证书的申请操作流程如下：
1． 用户带相关证明到证书业务受理中心申请证书
2． 用户填写证书申请表格和证书申请协议书
3． 业务受理中心录入人员将录入数据提交给RA中心
4． 业务受理点的审核员通过离线方式初步审核申请者的身份、能力和信誉等
5． 审核通过后，RA中心向CA中心转发证书的申请请求
6． CA中心证书审核操作员对提交的证书的申请进行复核，并保存审核结果
7． CA中心签名服务器为证书审核通过的用户签发证书
8． 如果证书介质是IC卡方式，则由印卡操作员对相应的IC卡进行印刷操作
9． RA中心定时从CA中心得到已签发的证书
10． 业务受理中心定时将在此受理点申请的证书取回
11． 业务受理中心的制作操作员打印对应证书的密码信封，并将该用户的证书灌制到证书介质中后通知用户一同领取
12． 用户根据用户应用指南使用相关的证书业务